Administrationen består av fyra enheter. Personal, ekonomi/fastighet, kommunikation och kyrkogårdsverksamhet. Församlingen driver också fyra förskolor.
Administrationen sköter ekonomi, fastigheter, personal, löner, kommunikation, IT-frågor, bokning samt ansvarar för ärenden som rör begravning, gravrätt och gravskötsel.
Gävle församling styrs av en politisk beslutsorganisation med kyrkofullmäktige, kyrkoråd samt valnämnd. Kyrkofullmäktige sammanträder två gånger om året för att godkänna bokslut, upprätta budget, besluta om kyrkoavgiften och ge förslag på begravningsavgiften.
Kyrkorådet ansvarar för övergripande mål, riktlinjer och ekonomiska ramar. Församlingen och kyrkogårdsenheten svarar för verksamheten.
Gävle församling har cirka 130 anställda och här finns präster, diakoner, musiker, församlingspedagoger, administrativ personal, vaktmästare, förskollärare, barnskötare och kyrkogårdspersonal.
Inom Gävle församling finns också högskolekyrkan, sjukhuskyrkan, familjerådgivning, Samtalsakuten samt Diakonirådet, som är en fristående stiftelse.