Sällskapet bildades 1986 efter att biskop Bengt G Hallgren tagit initiativ till detta genom ett möte i biskopsgården 1985 i närvaro av grundaren av motsvarande sällskap i Växjö stift. Sällskapets föregångare motsvarades i huvudsak av Härnösands stifts teologiska sällskap.
Under 2017 firas reformationsjubileet med anledning av att det var 500 år sedan Martin Luther spikade upp sina teser i Wittenberg. Stiftshistoriska sällskapet kommer att uppmärksamma detta genom ett antal symposier om reformationen och Luther runt om i stiftet.
År 2022 upphörde sällskapet att existera.