Gårdeby kyrka är uppförd under senare delen av 1100-talet eller under 1200-talet. Den gamla gråstenskyrkan är uppförd i romansk stil med långhus, lägre kor och absid (ett halvrunt rum, vanligen övertäckt med en kupol, som avslutar altarrummet i de flesta medeltida kyrkobyggnader) och saknar torn. Istället för en traditionell altartavla står i absiden Eva Spångbergs träskulptur "Den gode Herden" (1990).
År 1887 installerades en ny orgel som ersatte en orgel från 1780-talet som blivit obrukbar. Orgeln som finns idag byggdes 1951 av orgelfirman Åkerman och Lund i Stockholm.
Orgeln finns på en läktare som uppfördes 1682 för att bereda alla kyrkopliktiga plats i kyrkan. 1787 byggdes läktaren om och försågs med två ljuskronor i trä för fyra ljus.
I koret, längst fram i kyrkan, står en dopfunt av ek med åttakantig cuppa och rikt profilerad fot. På cuppans övre del finns utskuren dekor samt inskrift som visar att funten tillverkades 1664 och skäntes av kapten Petter Arendt på Össby. Till dopfunten hör en dopskål av mässing av 1600-talstyp.