Hejdeby kyrka är byggd under en period på ungefär 50 år med de äldsta delarna från början av 1200-talet.
Innan kyrkan restaurerades på 1960- och 70-talet så kallades den för ”Rosornas kyrka” på grund av de många målade rosorna. Men det bestämdes att man skulle prioritera medeltiden och måleriet från 1200-talet så då togs de senare målningarna bort.
Dopfunten i kyrkan är från omkring 1250-talet och har ett lock i trä. Locket är ett av bara tre bevarade på ön som har en kyrkmodell på locket.