Svenskt kyrkoråd
För att öka den kyrkliga närvaron i San Francisco inrättade Svenska kyrkans sjömansvårdsstyrelse 1996 en assistenttjänst knuten till den norska sjömanskyrkan. Diakonen Göran Runa blev den förste assistenten. I och med hans ankomst förstärktes verksamheten bland sjöfolk, turister och fastboende i The Bay Area. Behovet av samordning och ekonomisk stöttning av den svenskspråkiga verksamheten ökade nu alltmer. På den svenska generalkonsuln Siri Eliassons och Lisa Wiborgs initiativ bildades därför en ekonomisk förening, ett Advisory council, med syfte att samla medel till verksamheten och även fördela dessa. Detta San Franciscos första svenska kyrkoråd bildades 8 februari 1998 med Siri Eliasson som dess första ordförande. Denna dag får därför anses utgöra den formella startpunkten för en organiserad svensk församling i San Francisco. Rådet skulle sortera under St Erik’s Church Inc. i San Pedro, och den svenske sjömansprästen i San Pedro blev självskriven ledamot i rådet. Även den norske sjömansprästen i San Francisco knöts till kyrkorådet.
Den svenska församlingen i San Pedro hade antagit namnet St Erik som motsvarighet till den norska sjömanskyrkan St Olav i San Pedro. Namnet St Erik behölls även för San Francisco-församlingen till dess att utlandsförsamlingarna på 2000-talet fick Svenska kyrkans gemensamma benämning och grafiska profil. Församlingens nya namn blev då Svenska kyrkan San Francisco.
Verksamheten har även idag sin bas i Norska sjömanskyrkan http://sjomannskirken.no/san-francisco/. Det svenkspråkiga församlingsarbetet har emellertid vidgats och bedrivs nu även på olika platser runt the Bay Area.
Svenska kyrkan San Francisco har sitt uppdrag från Svenska kyrkan i utlandet med säte i Uppsala, SKUT, och är en av Svenska kyrkans erkända utlandsförsamlingar. Tillsynsansvaret över församlingen utövas av Visby stifts domkapitel.