Efter åskbranden som härjade den gamla kyrkan 1873 påbörjades planerna för att bygga en ny kyrka i Hyby. Denna gång närmare stora vägen och den planerade järnvägen mellan Lund och Trelleborg. Man fick uppskov med bygget för att kunna frakta byggmaterial med tåg.
Danske arkitekten Ludvig Fenger anlitades för att rita ett förslag. Eftersom han redan skissat på sankt Jacobs kirke i Köpenhamn skickade han helt enkelt över modellen och i Hyby antogs förslaget. Därför är kyrkorna än idag väldigt lika varandra. Dessutom ligger båda två 180 grader felvända, något som är väldigt ovanligt för landsbygdskyrkor som Hyby nya kyrka. Felvänd menas här med att tornet ligger i väster och inte i öster som är det vanligaste.
Det finns många berättelser om varför. En populär teori gör gällande att jorden under tornet inte skulle orka bära vikten om kyrkan legat på rätt sätt då markmaterialet är annorlunda under koret. En annan säger att det enbart har praktiska skäl då porten nu vätter åt byn och man slipper de västliga vindarna från slätten. En tredje kan handla om att det blev arkitektens signum då sankt Jacob ligger precis likadant. Dock har det en större poäng i centrala Köpenhamn eftersom porten vätter åt huvudvägen mellan Köpenhamn och Helsingör. Fengers originalmodell upphittades i modern tid och finns renoverad i en glasmonter inne i kyrkan.
Än idag är kyrkan ett imponerande bygge och kallas ibland katedralen på slätten och spiran tornar hela 42 meter över marken. Inventarierna har tillkommit under de första decennierna efter kyrkans tillkomst med undantag av triumfkrucifixet och kyrksilver som räddades i åskbranden från den gamla kyrkan.
Hyby nya kyrka fungerar utmärkt till både dop, konfirmation, vigsel och begravning, i synnerhet vid större sällskap. Församlingen använder den främst vid större kyrkohelger som jul och påsk samt vid konserter och konfirmationer. Kyrkan rymmer 425 personer och kan upplevas som enorm i sammanhang med få besökare. Vid dop används oftast det högra sidoskeppet, där dopfunten är uppställd längst fram.
