Stockholms domkyrkoförsamling bedriver musikverksamhet i S:t Jacobs kyrka och ger oftast en fredagskonsert och lördagskonsert. S:t Jacobs Kammarkör och S:t Jacobs Vokelensemble är grundade där. För konserter se kalendariumet här nedan.
1989 hade S:t Jacobs församling 150 kyrkotillhöriga, vilket inte var tillräckligt för att vara egen församling och upprätthålla verksamheten. Kyrkan slogs då samman med Storkyrkoförsamlingen och S:ta Clara församling till Stockholms domkyrkoförsamling.
Sedan 2019 är Stockholm stift är ägare av Sankt Jacobs kyrka, dess kyrkogård och det före detta församlingshuset.